狮子洋隧道位于广州市番禺区石楼镇及东莞市麻涌镇内。该区域属于珠江三角洲海陆交互平原地貌。该地段地形为珠江两岸平坦开阔地带，视野较为开阔，水塘呈零星分布。地面高程1.56～5.52m，相对高差3.98m。

狮子洋隧道长6150m（双线长度，含U型槽）。线路从莲花站引出后，在莲花山北侧约800m茭塘东村附近与新沙港4#、5#码头之间下穿珠江狮子洋水道，下穿新沙港区后线路沿西部干道前行，在中纺粮油公司前线路向南偏离西部干道，过中纺粮油公司后线路迅速出地面，至本次设计终点。